発送待ち、に、２件残っているのですが、発送日は入力されていて、もしかしたら、課金確定を押す必要があるということですか？

「発送待ち」は、受注ステータスのことなので、注文詳細の画面から「受注ステータス」のボタンを押して、「完了」を選択すれば良いと思います。

「課金確定」は、今まで押したことないです。