同じ商品３つを1つの注文だと明日に届き、3つになると2週間後になってしまいます。どうしたらいいですか？

3回に分けて注文してますよ。
ただ、まとめて届かないことがあるので、Amazonの配送を確認しながら、「倉庫で別れて梱包されてしまったので、同時に届かないかもしれないです。」みたいなメッセージを入れます。
(バラバラに注文しても、連続してると、一緒に梱包されることもあります)